L’Institution Sainte-Anne veut enseigner les vérités révélées par Jésus-Christ et enseignées par l’Église. L’enseignement des sciences ne se cantonne pas à décrire ou à expliquer, mais invite, au moins implicitement, à l’admiration de la création et donc du Créateur.

     Par ailleurs, l’enseignement de l’histoire n’apprend pas simplement la chronologie de la France, les événements notables et les personnages marquants, mais il essaie de « donner le sens du droit naturel, de la vie politique juste, de la patrie, de la collaboration entre les patries, de la soumission de nos patries charnelles au Christ-Roi. »
(Père Calmel, École chrétienne renouvelée) Les cours de français, dans le choix des textes,  entendent aussi mettre en valeur les bons sentiments et de vraies exigences morales.

      Les enfants étudient suivant les méthodes syllabiques, du « par cœur », de l’histoire chronologique, etc… Ils apprennent également la liberté́ dans le discernement et la responsabilisation.

     La pédagogie traditionnelle est la priorité du projet d’éducation donnée à l’Institution Sainte-Anne. Dans chaque enseignement, les professeurs cherchent à former l’intelligence et le jugement de leurs élèves. Pour ce faire, la méthode d’enseignement est structurée, logique et progressive.

     L’accomplissement du devoir d’état  est particulièrement mis à l’honneur, car c’est bien en réalisant leur devoir d’état, c’est-à-dire en s’instruisant que les élèves se sanctifient.

     Notre pédagogie vise à rendre l’élève capable de « donner le meilleur de lui-même dans la quête de l’excellence intellectuelle » (Extrait de la Charte de l’Institution Sainte-Anne). Elle concourt particulièrement au développement des vertus qui en feront un bon élève : la promptitude à se mettre au travail, la constance à y demeurer et, l’application qu’on y consacre. 

     Notre projet pédagogique se fonde sur le Catéchisme et respecte les règles de la morale de l’Église. De plus, les enfants assistent à la Messe chaque semaine et prient pour leurs bienfaiteurs tous les jours. ​L’Institution Sainte-Anne est attachée à la forme extraordinaire du rite romain. 

     La responsabilité d’enseignant, en lien avec les parents, appelle à instruire  les élèves pour les aider à grandir et à avancer dans la Foi. Dirigée par l’Institut du Christ-Roi-Souverain-Prêtre, l’Institution Sainte-Anne s’emploie à enseigner aux élèves les valeurs chrétiennes, selon la tradition du Magistère de l’église et en communion avec le Saint-Siège. 

     Les élèves côtoient un prêtre régulièrement, non seulement à l’occasion des heures d’instruction religieuse hebdomadaires ou de la messe, mais aussi au moment des récréations et des confessions.